1.程序上的区别
男女双方自愿的，可以持相关资证件到机关办理离婚手续，也可以在中，经法官调解离婚。但不同的是登记机关发的是离婚证，而法院发的是离婚调解书，法院发的调解书就等于离婚证，不必再去婚姻登记机关领取离婚证了。
2.性质上的区别
的内容上包括了三方面：
（1）自愿离婚，即男女双方都自愿解除婚姻关系；
（2）子女抚养，子女抚养涉及到了、的确定，还包括未抚养方的探视权及保障等内容；
（3）财产分割及债务处理，财产分割及债务处理主要包括夫妻婚姻关系存续期间的共同财产分割和共同债务的清偿等。
离婚协议是一种混合合同的性质，且必须是书面形式，我国是不支持口头、电子邮件等形式的离婚协议。这是与民商事合同可以采用书面形式、口头形式和其他形式的区别;离婚协议的离婚部分是不可变更、撤销，这又与民商事合同，可以变更、撤销相区别。
3.效力上的区别
离婚协议和法院调解离婚有同样的效力，登记离婚协议经民政局发给离婚证时生效，而诉讼调解经签字起即时生效，登记离婚协议的财产关系，不能以一方不按照登记离婚协议的内容履行义务，直接申请人民法院强制执行，而需要通过人民法院确认后，方能申请人民法院强制执行;而诉讼离婚调解书的财产关系，一但履行一过，当事人可以直接向人民法院申请强制执行。登记离婚协议与诉讼离婚协议都不得上诉，不得申诉。
二、离婚协议法院调解具有法律效力吗通过向法院提起诉讼来解除婚姻关系，也叫诉讼协议离婚。诉讼协议离婚是可以根据法院调解来达成法律效力的。
具体程序是：
1.向法院提交民事起诉书，及与离婚相关的证据材料，如证、子女的出生证明、财产证明等等；
2.法院依法受理后，会进行审查，如双方确系自愿离婚，并已就子女抚养、抚养教育费的支付、的分割、夫妻共同债务的清偿等等达成了一致的协议；
3.法院经过审理查明，双方对协商一致的财产分割、子女抚养等问题无争议且符合法律规定，法院出具调解书或判决书，解除双方夫妻关系。
从法院出具的调解书或者判决书生效时起，双方的协议离婚产生法律效力。
协议离婚无论是通过到民政局登记离婚，还是通过法院调解协议离婚，只要拿到解除婚姻关系的生效证明，如离婚证、离婚调解书/判决书，都具有法律效力，双方就解除婚姻关系。
三、签了离婚协议书后还能反悔吗法行时刻提醒您，男女双方协议离婚后一年内就财产分割问题可以反悔。
夫妻协议离婚时，男女双方必须亲自到民政部门办理离婚手续，同时必须向民政部门提供双方签订的《离婚协议书》，《离婚协议书》中应当对婚内夫妻共同财产分割、子女抚养、夫妻债权、债务承担等问题达成明确、一致的约定。双方一旦办理完离婚手续，男女双方均应当按照《离婚协议书》中的约定，对婚内财产进行分割，任何一方当事人都不能反悔。这是因为《离婚协议书》是双方当事人在平等自愿的前提下，协商一致的结果。对于任何一方来说，都是对自己财产权利的一种自由处分，对双方具有法律约束力。
离婚协议中关于财产分割的条款或者当事人因离婚就财产分割达成的协议，对男女双方具有法律约束力。 在现实生活中，个别当事人出于急于离婚方面的考虑，可能会在财产分割方面向对方当事人做出一些让步，甚至是较大的让步，这在法律上是不被禁止的。
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